南开大学APEC研究中心依托各方资源，在多个领域积极开展工作，主要包括：组织本校和全国范围内的科研人员深入开展有关APEC问题的研究，为我国政府参与APEC合作提供决策咨询服务；为中国企业积极参与APEC活动提供咨询；为政府部门和企业培训博士、硕士等高层次的专门人才；加强与其他成员的APEC研究和国际学术交流，建立广泛而稳定的学术联系；不断充实和加强与APEC问题有关的信息资料建设等。研究中心的目标是要努力建成集学术研究、人才培养、咨询服务以及信息资料建设多重功能于一身、运作机制高效、灵活的新型科研机构。
研究中心现有专职研究人员10人，均拥有副教授以上高级职称。此外，研究院还拥有一支稳定的兼职研究人员团队，由来自北京大学、人民大学、北京师范大学、复旦大学、武汉大学、浙江大学、厦门大学、吉林大学和社科院系统的二十余位专家学者组成。研究院每年招收多名世界经济专业硕士、博士研究生。研究中心和相关部委长期保持着密切的工作联系，还聘请了中国外交部副部长张业遂、国家发展改革委员会副主任解振华、中国商务部前副部长龙永图等多位官员担任兼职教授。